| -auto | Start bouwen automatisch |
| -exit | Sluit PE Builder automatisch na bouwen.
Als er fouten zijn tijdens het bouwen dan sluit PE Builder niet! |
| -overwrite | Overschrijf doel map automatisch (vraag niet om bevestiging) |
| -verbose | Zet uitgebreide meldingen aan |
| -skipregistry | Sla register bestanden bouwen over |
| -skipfiles | Sla bestanden kopiëren over, handig als je veranderingen aan het testen bent die alleen voor het register zijn. |
| -buildiso | Bouw de ISO-image, genereer alleen de ISO-image vanaf je doel map (brand ook een CD/DVD als nodig) |